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大数据追踪或能帮助找到最危险的癌细胞

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致癌细胞被认为是干细胞。它们很难找到能够自我增殖并产生特殊组织(如皮肤或肌肉)的细胞。当它们恶化时,就会产生癌症。
在一项新的研究中,来自斯坦福大学、中国西湖大学和荷兰莱顿大学医学中心的研究人员发现,找到一个数字可以帮助他们找到最危险的癌细胞。据出国看病服务机构携康国际了解,他们还发现,细胞用来制造RNA的基因数量是细胞发育的可靠指标,这一发现可能使靶向癌基因变得更容易。相关研究成果于2020年1月24日发表在《科学》杂志上,论文题目为“单细胞转录多样性是发展潜力的标志”。
  论文的对应作者、斯坦福大学干细胞生物学和再生医学研究所成员、生物医学数据科学副教授亚伦·纽曼博士说:“目前,靶向治疗主要针对特定基因或分子,其中大部分可能不是癌干细胞特异性。这些疗法通常不起作用很长时间。但如果你能识别出分化程度最低的细胞并寻找它们的特定标记,那么寻找目标基因就不再是一场猜谜游戏了。”
  这项研究的发现也很重要,因为在各种组织中鉴定干细胞是再生受损或功能失调组织的重要步骤。
  这些研究人员发现,随着干细胞分化程度的提高,它们越来越像成体细胞,表达的基因也越来越少。在此之前,其他人已经注意到这种关联,并认为这可能是一个有趣的巧合。但纽曼和他的同事们是第一个在公共数据库中对数千种单细胞基因测试进行分类的人,并确认这种模式是一致和可靠的。本文的合著者Newman和gunsagar Gulati将细胞中表达的基因数的测量结果与每个基因产生的RNA拷贝数的测量结果结合起来,作为计算机算法cyclotrace发展的基础。这种算法旨在确定细胞的发育程度.
  肿瘤细胞是多种多样的
  肿瘤可以包含数百万个细胞,每个细胞可能有数千个基因突变。肿瘤细胞是多种多样的。大多数癌细胞是自然死亡的分化细胞,而更危险的癌干细胞或肿瘤始动细胞相对较少。这些细胞很难找到,因此很难用现有的方法来描述,但用环追踪法更容易找到。
  这篇论文的联合主要作者Shaheen Sikandar博士说:“作为一名癌症研究者,我发现最令人兴奋的事情是,这个工具可以帮助我们找到长期以来已知的肿瘤始动细胞,它们在治疗后会导致治疗抵抗、转移和复发,并产生耐药性。”,斯坦福大学医学教授,是第一位在实体肿瘤中发现肿瘤干细胞的研究者。克拉克说,当cytotrace分析单个细胞中产生的所有RNA的数据时,它可以快速总结使用传统方法需要数年时间才能完成的研究。”我们目前寻找肿瘤干细胞标志物的方法是对潜在的重要标志物进行有根据的猜测,然后对这些细胞进行分类,寻找干细胞活性,”克拉克说,在此之前,科学家一次只能观察到相对较少的标志物,所以他们需要进行大量的分类和分析。最后,他们可能只能部分成功地找到他们正在寻找的更好的干细胞标记。”cytotrace允许我们首先找到干细胞或祖细胞,然后研究它们表面有什么独特的标记。”
  在本文中,出国看病服务机构携康国际了解到,研究人员描述了使用cytotrace查询来自三阴性乳腺癌的单细胞RNA数据。三阴性乳腺癌很少见,但更危险,因为肿瘤的生长并不依赖于医生治疗乳腺癌时通常针对的生化途径。细胞跟踪技术不仅可以识别已知的肿瘤干细胞标志物,而且可以发现以前认为不重要的标志物。纽曼说,细胞追踪有可能改变科学家寻找与其他疾病相关的干细胞的方式。他说,“这种工具可能也可用于寻找阿尔茨海默病或其他退行性疾病等疾病的治疗方法在退行性疾病中,干细胞功能的丧失可能是疾病过程的一部分。”
再生医学,即通过干细胞的活性修复病变或受损的组织,有必要分离特定组织的干细胞群。例如,要再生骨骼、心脏或眼睛,科学家必须首先找到负责再生这些器官的干细胞。研究人员说,找到这些正常干细胞特异性标记的过程与找到癌症干细胞标记的过程非常相似,也就是说,这是知情猜测、运气和实验室大量研究的结果。环行追踪可以大大缩短这一过程。古拉蒂说:“发展细胞追踪的主要动机之一是建立一种能够快速准确识别人类干细胞的工具。然而,我们想回答的另一个重要问题是,当细胞从一种状态变化到另一种状态时,细胞的内部功能是如何变化的。这项研究为研究基因表达和DNA结构的整体变化如何影响细胞状态开辟了一条新途径。”
纽曼说,总的来说,这项研究显示了利用大数据通过计算机研究促进生物和医学发展的力量和前景,计算机研究可以作为实验室发现的补充。他说:“我们实验室不可能收集到所有这些数据,但通过使用公共数据库和提出正确的问题,在生物学和医学方面取得基本发现的可能性越来越大。”
本文为海外就医科普文章,内容仅供阅读参考,不作为任何疾病治疗的指导意见。
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