对于疫苗治疗上的靶标，目前已经确认了许多癌症免疫治疗的可能靶点，包括两类主要的肿瘤抗原：肿瘤特异性抗原和肿瘤相关抗原。对于肿瘤特异性抗原，它是肿瘤细胞表达的基因产物，如点突变的癌基因、突变的抑制基因、抗独特型抗体和基因易位，由传染性病原体驱动产生的病毒衍生物等。
海外医疗服务机构介绍，人类肿瘤中有20%~30%存在某些突变，已经开发了靶向这些突变的疫苗载体。胰腺癌、结肠癌和肺腺癌早期临床研究结果显示，靶向疫苗有良好的应用前景。海外医疗服务领域了解到，在B细胞淋巴瘤细胞表面过表达，是一种单一的免疫球蛋白变体，因此每一种B细胞淋巴瘤，都具有一种独特的免疫治疗靶点。
肿瘤相关抗原与正常组织相比，在癌细胞中会有过度表达的蛋白质，主要包括肿瘤胚胎抗原，癌基因及基因产物，组系抗原和病毒抗原等四种。肿瘤胚胎抗原如癌胚抗原，通常在胚胎发育的过程中存在，但出生后大幅度下降。
而转录因子则是一种在胚胎发育过程中，胚层形成上起至关重要作用的蛋白。在绝大多数正常组织中检测不到，但是在肺、结肠、小肠、胃、肾、膀胱、子宫、卵巢、睾丸的肿瘤组织，以及来自于肺、结肠和前列腺癌的细胞系中，存在有过表达。