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日本看病 超级计算机模拟分析癌症多样性
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研究小组在imsu主管的指导下,通过对各种条件的大规模并行模拟,确定了产生各种进化模式的条件。通过为了解癌症的演变提供数学基础,本研究有望有助于了解癌症的治疗耐药性,并开发新的治疗策略。
各种数学原理可以解释癌症的演变过程,一般认为在癌症发展过程中,正常细胞通过不断获取有利于细胞生长和存活的驱动基因突变,逐渐演化为恶性程度高的同质细胞群。然而,近年来从多个肿瘤区域获得的DNA样本的多区域测序证实了肿瘤内异质性的特点。也就是说,在肿瘤的进化过程中,会产生多个具有不同突变的克隆,并在单个肿瘤中共存。
另一方面,已经发现,ith可以由不影响细胞生长和存活的中性突变的累积形成。也就是说,它可以由中性进化产生。 ITH的演化原理不仅在癌症类型之间有所不同,而且Niida及其同事还发现大肠肿瘤发生期间会发生时间变化换句话说,在早期病变中,它是自然选择形成的,而在晚期癌症中,它是中性进化形成的。此外,与上述单核苷酸突变的逐步积累所导致的逐步进化相反,一种称为标点进化的模型特别引起了研究者的注意。这种进化模式使癌细胞在短时间内发生染色体和基因组水平的巨大变化,如拷贝数的变化和结构的异常。
到目前为止,已有四种进化模型被提出,但这些模型的产生条件仍有许多不清楚的地方。模拟分析的使用被认为是了解癌症演化的有用工具。日本看病机构携康国际医疗了解到,在这项研究中,研究组通过超级计算机的模拟分析阐明了癌症进化多样性的基本原理。由于癌症具有很高的进化潜能,它能够适应治疗所改变的环境,并且很容易获得对治疗的抵抗力。因此,了解癌症的演变是设计治疗策略的一个重要问题。通过为了解癌症的演变提供数学基础,本研究有望有助于了解癌症的治疗耐药性,并开发新的治疗策略。
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