对于一些客观有效率、常不到10%，且中位生存期较短，还需要探索更有效的治疗方案。分子靶向药物，也逐渐用于治疗SCCHN。主要的临床研究，都是针对复发、转移性患者。许多是针对EGFR的靶向药物和抗血管生成药物，相关的研究正在进行中。
其他有前景的新物，包括以EGFR和VEGF下游信号通路为靶点的药物，针对PI3K信号通路的药物，HER3单克隆抗体，以及免疫治疗。海外医疗大量研究，正致力于如何能预防头颈部恶性肿瘤的发生。
迄今为止，若干实验已证明3-胡萝卜素和顺式维甲酸，能使已经存在的癌前病变。如黏膜白斑病消退，但是这种作用仅是暂时的，且没有证据表明、这种治疗能减少高危患者的第二原发癌的发生。
一些小规模的研究提示，其他一些药物有可能延缓头颈部恶性肿瘤的形成，如从绿茶和姜黄素中提取的儿茶素，没食子酸酯。普遍接受的观点是，戒烟、戒酒可以降低患原发头颈部恶性肿瘤的风险，但是目前仅是推测。