Rack等的研究发现，曲妥珠单抗对于消除无复发乳腺癌患者、骨髓HER2阳性细胞是有效的。鉴于微小残留病灶的异质性，这些安德森癌症中心转诊后的患者，可能从联合靶向治疗中获益。ER阳性乳腺癌，经常在初次确诊的多年后复发，因此理解复发时间的模式，有助于确定患者是否需要更多的进一步治疗。
对早期治疗失败的可靠预测，也有助于确定患者是否需要辅助化疗，来预防早期远处转移。有研究前瞻性检测了119位，接受他莫昔芬治疗的ER和（或）PR阳性患者，CX-79mRNA阳性细胞，分析得出他莫昔芬治疗期间出现CX-79 mRNA阳性CTC，与高复发风险相关。利用早期和晚期复发肿瘤细胞的分子差异，可以指导这组患者进行有效的新药联合用药。
为实现这一目标，Liu等的近期研究提供了清晰的证据，虽然接受联合他莫昔芬辅助治疗，但早期复发ER阳性乳腺癌患者，和晚期复发ER阳性乳腺癌患者之间，存在分子差异。Liu等还分析了乳腺癌活检标本中的基因表达，然后比较了其与远处转移的关系，发现运用一个包含91个基因的基因分类，能可靠区分早期复发和晚期复发。
安德森癌症中心转诊后乳腺癌患者CTC持续存在，很有可能与干细胞样肿瘤细胞有关，后者被认为是原发肿瘤中转移播散细胞的活跃来源。目前的模型表明，侵袭相关表型与上皮-间质转化（EMT）有关，EMT使肿瘤细胞从原发灶脱落以及转移。相反的步骤，间质-上皮转化（MET）可能在CTC于远处器官柄居和建立转移灶时起作用。
然而，关于EMT和MET的确切机制，以及它们的相互作用知之甚少，它们与癌症患者的相关性尚不清楚。安德森癌症中心转诊过程中，部分CTC显示EMT和干细胞的特征，多个研究组刚开始将EMT相关标记，应用于癌症患者的CTC研究。