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淋巴瘤治疗对癌症基因组诊断十分重要
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实际上,NGS数据中也能获得拷贝数的改变,和结构重排的信息。但后者结果尚不稳定,还需要做大量的工作,并将大片段插人和缺失的检测,作为常规分析项目。肿瘤DNA的表观遗传学变化也能够通过NGS确定,但是方法还不适用于临床应用。淋巴瘤转诊后的这些改变类型,在癌症基因组诊断上都是重要的,将成为NGS平台癌症分子检测的一部分。
后,基因表达谱检测是NGS的一个强有力的方法(RNA测序)。通常与可行的基因列表类似,基因表达特征涉及数量有限的基因,并好能够通过其他方法进行检测,如用MammaPrint和OncotypeDX预后,生物标记物检测浸润性乳腺癌。淋巴瘤转诊治疗机构携康国际介绍,目前RNA测序是一种强大的科研工具,能够对差异表达和剪切,对RNA编辑和等位基因特异性表达等进行深入研究,这些发现可能在未来提供更多的分子检测靶点。
随着NGS技术继续发展,淋巴瘤转诊检测费用将下降,读长和精确度将提高,分析方法将得到改进。这将使全基因组测序和RNA测序,成为更主流的检测方法,从而提供综合癌症基因组分析数据。这将促进对偶然发现的报道,并提高诊断和预后的能力,从而为个体化治疗添砖加瓦。
好早以前,大量研究方法的出现,使得微阵列技术应用到肿瘤的研究中。尽管存在几种不同的平台,但所有微阵列技术的基本原理是相同的,它由一个固定于固相载体的大量探针,组成载玻片或芯片。每一个探针都被设计成专一识别单个目标分子的结构,这使同时识别大量目标靶分子成为可能。淋巴瘤转诊后,被标记的靶物质杂交于微阵列芯片,与特异性的探针相结合。因为每一种探针的位置都有特定的标识,所以扫描每一种标识的信号强度,就能得出靶点分子的平行检测数据。
目标信号的强度与被检测样本的量,在一定范围内是成比例的,这个范围为高于检测下限与低于饱和度上限的范围之间,也就是在系统的动态范围内。这项应用在淋巴瘤转诊上的技术,有其固有的灵活性,改变排布于微阵列上的探针类型,就能够检测不同分子种类。例如,用抗体作为探针的微阵列,能够用于蛋白质组学分析。
淋巴瘤转诊治疗机构携康国际介绍,然而,广泛应用的微阵列类型是DNA微阵列,它是使用DNA探针来定量DNA或RNA(通常是通过cDNA)。DNA微阵列技术应用广泛,例如以阵列为基础的比较基因组杂交,以阵列为基础的基因分型、表观遗传学图谱。但重要的是,鉴于微阵列的广泛性和灵活性应用,DNA微阵列仍然是转录组分析标准的方法。
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