然而，质子治疗的动态照射的潜力，也已开始被积极研究。PaulScherrer研究所（PSI）开始了动态方法的研究，20世纪90年代早期，世界上早发展出笔形束扫描机架，在1996年第一次治疗了患者。扫描想法被Kanai等早提出，但直到20世纪80年代晚期基于机架的质子治疗设备，在PSI发展才得以实现，90年代早期这项技术才进人临床实践。
笔形束扫描方式的灵活性，近来在PSI被扩展以进行调强质子放射治疗（IMPT）。IMPT直接等同于光子的IMRT，IMRT的每个射野照射一个经过优化的、不均匀的注量分布，所有射野照射完成后合成得到所需的剂量分布。IMRT和IMPT都具有照射任意复杂的注量分布的能力，可在调整靶区的剂量分布，并选择性地避开重要器官，比散射光子或质子治疗可提供更多的灵活性。
从治疗计划、照射方式和其临床实现和实用性等方面，调强质子治疗。IMRT的初含义更模糊，但这项技术使放射治疗实践，发生了彻底变革是无可争议的。然而正如其他争论，这个词容易引起误解。多数光子IMRT照射系统实际上是通过改变，在某一位置射线的驻留时间以调整注量（即每单位面积照射的粒子总数），而不是直接调整强度（每单位面积单位时间内照射的粒子数）。然而更重要的是，IMRT的成功并没有在其调整过程中作假，射野挡块和楔形板可被认为是调整射线的装置，但这些装置的单独使用都无法满足IMRT的意 思。赴美就医在IMRT治疗计划的能力方面，和从每野照射任意复杂注量分布的照射系统方面作了假。
因此，IMRT作为一种照射方法，只能在计算注量分布的算法，被包含在计划过程和支持这种注量分布照射，如动态多叶准直器中的装置中才能实现。如所述质子笔形束扫描是一种动态照射技术，依赖于能量和注量的调整，通过改变射线的驻留时间或改变射线强度，及治疗计划过程中计算注量和能量的一种优化算法，IMRT只实现了垂直射线方向平面内的注量的调整。因此，IMRT是一种按给定治疗计划限制条件，优化平面内一点的注量的“二维”优化问题。
与之相反，IMPT拥有一个由射线能量，提供的额外的自由度，其支持沿射线方向放置原始Bragg峰。因此，IMPT射野调整注量和每个原始Bmgg峰的位置，实现了靶区内的“三维”优化。因此，单独的IMPT射野即可实现靶区的完全剂量覆盖，但与多野相比可能不是优的。