肛门上部淋巴组织经直肠壶腹周围与慨骨、上结肠系膜和主动脉旁的淋巴结相交通。肛门下部淋巴组织与会阴部淋巴结相交通，并汇人腹股沟浅表淋巴结。在接受经腹部会阴切除术（AP）治疗的患者中，有25%~35%证明存 在盆腔淋巴结的转移。肛门癌中，鳞状细胞癌占63%，移行细胞癌（泄殖腔原细胞癌）占23%，黏液腺癌占7%（通常合并多个瘘道）。基底细胞癌（2%），可经局部切除或放疗治愈。佩吉特病（2%）是表皮内顶浆分泌腺的恶性肿瘤。恶性黑色素瘤（2%）多见于齿状线附近，呈单发或多发的息肉状肿块，预后较差，主要取决于肿物的大小和侵袭程度。
其他组织分型包括小细胞癌（罕见但极具侵袭性），疣状癌（与巨大尖锐湿疣相关的息肉状赘生物）、鲍恩病、胚胎横纹肌肉瘤、恶性淋巴瘤。症状出血50%、疼痛40%、胀气25%、瘙痒15%，大约25%的出国治疗患者无任何症状。体格检查包括肛门直肠指检、肛门镜检查、直肠镜检查、必要时进行超声内镜检查，以及腹股沟区淋巴结触诊。
对于重度疼痛或肛门痉挛的患者，肛门直肠检查应在患者镇静时或全麻下进行。切开活检是必要且比较可行的确诊方法，切除活检应避免，可疑的腹股沟淋巴结也应进行活检，以鉴别肿大的淋巴结源于炎症反应还是转移性疾病。针吸细胞学检查也可以确立诊断，若结果是阴性，则应进一步行手术活检，许多外科医师建议进行前哨淋巴结活检以提高肿瘤分期的准确性。
出国治疗服务机构携康国际介绍到，肿瘤分期手段包括：体格检查、胸片、LFT、盆腔CT和肛管超声内镜检查；对于有感染HIV危险因素的患者，HIV检测也是很有必要的。常用TNM分期，由于疾病分期方法的不断更新，建议读者查阅新的分期指南。肛缘癌的分期方法同皮肤癌。肛管癌的T分期代表肛管肿瘤的大小和邻近器官的侵袭程度，任何大小的肿瘤侵袭邻近器官或组织尿道、膀胱，仅累及直肠壁、直肠周围皮肤或皮下组织、或肛门括约肌。
TNM分期属于TIs的患者，有向更高T分期进展和广泛浅表性播散的倾向，尤其见于HIV阳性的患者。分期为T1（癌肿直径<2cm）患者的预后较原发病灶较大的患者为好。T1和T2期患者5年生存率大于80%，而T3和T4期患者5年生存率小于20%。
对于病变直径大于6~10cm的患者，即便是采取了积极的治疗其生存率仍不髙。出国治疗服务机构介绍，一项多变量分析试验显示，T分期是肛门癌唯一的独立预后因素，但合并淋巴结转移的病例预后同样不好；肛门癌多数是局限进展，远隔淋巴结转移病例少于10%。