临床上常见的肿瘤有两种：肺癌和乳腺癌。额外的辅助检查对于这些患者的管理非常重要。以往肺癌患者分为小细胞肺癌(SCLC)和非小细胞肺癌(NSCLC)，NSCLC又分为鳞状细胞癌、腺癌、大细胞癌或其他非特异性癌(NOS)。
　　非小细胞肺癌的所有病理类型都被归类为一种疾病，因为在治疗不同组织类型的非小细胞肺癌时没有特异性。随着治疗方案的增加和腺癌新亚型的出现，目前已知非小细胞肺癌并非都是同一种疾病，其治疗和预后也有很大差异。例如，鳞状细胞癌占非小细胞肺癌的20%，主要发生在吸烟患者身上。
　　肺癌简单分型中长因子受体(EGFR)突变对培美曲塞的影响较小。培美曲塞联合顺铂组的中位生存期较非鳞癌组短3个月，吉西他滨联合顺铂组的中位生存期延长近2个月。因此，可以为患者做出更好的治疗决策。
　　对于NSCLC患者，除了病理学外，还需要了解NSCLC的分子特征，以确定合适的治疗方案和预测预后。在NSCLC组织学标本中检测到EGFR基因突变、ALK易位和RAS突变。
　　非小细胞肺癌中EGFR突变的发生率约为15%，常发生在非吸烟患者中。这类肿瘤对口服EGFR酪氨酸激酶抑制剂(吉非替尼或厄洛替尼)敏感，患者预后相对较好。
　　数据显示，ALK易位也发生在无烟患者身上，但仅发生在少数患者身上，NSCLC患者不到4%。这些肿瘤对一种新的酪氨酸激酶抑制剂(clozatinib)敏感，能显著改善预后.