如果放疗的目的是治愈，则放疗剂量需大于60Gy以达到局部控制；受到传统放疗技术的限制，质子和光子放疗在软骨肉瘤治疗中都有应用。与脊索瘤类似，大多数软骨肉瘤放疗的数据，来源于颅底病变。文献报道局部控制率在3年94%到5年73%之间，照射剂量为50~83GyRBE。
像脊索瘤一样，剂量提升的重要性被一再强调。Austin等报道了141例颅底和颈椎脊索瘤、和软骨肉瘤患者质子放疗的疗效，有26例局部复发，其中只有6例患者复发病灶处接受过70Gy以上的放疗。15例复发患者的复发部位，既往接受过低剂量放疗。
放疗中对肿瘤邻近重要解剖结构的避让，常常是造成低剂量和局部失败的原因；这篇文献强化了颅底病变剂量的不均一性、与局部失败风险之间的关系。在一组研究，脊索瘤3年局部控制率为69%，而软骨肉瘤为91%；他们的研究结果，体现了肿瘤区域要被有效剂量充分覆盖的重要性。
另一个重要发现是，局部控制与更小剂量有关，一个可变因素是正常组织的剂量限制；仍有大多数文献认为，外科手术是这种病理类型疾病治疗的主要手段。出已发表的数据表明，局部控制率依赖于放疗时、局部残留病变的大小。
重碳离子或其他带电粒子放疗，是另外一些引人关注的放疗模式。质子的物理学优势，是结合了一个更高的放射生物效应；Schulz-Ertner等报道过重碳离子、治疗颅底软骨肉瘤的疗效与毒性反应。
 

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