质子重离治疗 怎样鉴别癌细胞畸变的患病率
针对微阵列技术的一个有趣的应用是,它能检测新的融合基因,且癌基因组中越来越多地发现了融合基因。它还常见于肉瘤和血液肿瘤,突出的例子有前列腺癌中的ETS融合,非小细胞肺癌中的ALK融合基因。质子重离子治疗转诊机构携康国际了解到,分析了小部分癌细胞系,利用配对末端测序方法,寻找新融合基因和基因重排,而不只是通过单独的CNA方法鉴别。
近来,继许多乳腺癌和大肠癌全外显子组测序的公布,许多GBM、胰腺癌和肺癌基因组也随之公布。质子重离子治疗转诊机构携康国际了解到,尽管这些基因组,尚未被用于新的基因重排的深入研究,但在当前治疗效果差、致死的恶性肿瘤情况下,新的融合基因或者激活性突变,很有可能作为新的药物靶点,该领域亟待这些分析。
在基因组异常的区域,鉴别导致畸变的基因至关重要,同时具有挑战性。CGH和分子细胞遗传学技术证明,成百上千的基因,质子重离子治疗转诊机构携康国际了解到,可通过基因组拷贝数改变而下调;且DNA测序证明了数百种候选癌基因突变的存在,呈现了在个体肿瘤中几十到几百种突变。
现在一个关键的问题是,这些异常中,哪些在癌进展中起着重要的作用?重要的是,拷贝数畸变检测,质子重离子治疗转诊机构携康国际了解到,可通过如癌细胞靶点的基因组鉴别(GIST1C)的算法进行。这种算法,系统地比较样本中发生畸变的患病率,并且能考虑到畸变的频率和相关程度等。